| Індекс структурного підрозділу | Назва структурного підрозділу |
| 24-13-00 | Керівництво |
| | Начальник |
| | Заступник начальника |
| 24-13-01 | Управління організації роботи |
| | Відділ організації, планування роботи, моніторингу та контролю |
| | Відділ організації документування і роботи з документами |
| | Сектор розгляду звернень громадян та доступу до публічної інформації |
| 24-13-04 | Управління оподаткування юридичних осіб |
| | Відділ аналітичної роботи |
| | Відділ контролю за відшкодуванням ПДВ |
| | Відділ податків і зборів з юридичних осіб інших галузей |
| | Відділ податків і зборів з юридичних осіб у галузях торгівлі, діяльності готелів та ресторанів |
| | Відділ податків і зборів з юридичних осіб у галузях промисловості, постачання електроенергiї та водопостачання |
| | Відділ податків і зборів з юридичних осіб у галузі сільського, мисливського та лісового господарства |
| | Відділ податків і зборів з юридичних осіб у галузях будівництва, транспорту та зв'язку |
| | Відділ податків і зборів з юридичних осіб у галузях державного управління, освіти, охорони здоров’я та інших видів послуг |
| | Відділ податків і зборів з юридичних осіб у галузях інформації та операцій з нерухомим майном |
| 24-13-05 | Управління правового забезпечення |
| | Сектор правового супроводження діяльності та супроводження судових спорів із загальних питань |
| | Відділ супроводження судових спорів |
| | Відділ інформаційно-аналітичної роботи |
| 24-13-07 | Управління податкового аудиту |
| | Відділ планових перевірок |
| | Відділ позапланових перевірок ризикових платників та аналізу податкової інформації |
| | Відділ перевірок з питань відшкодування ПДВ |
| | Відділ позапланових перевірок з інших податків |
| | Відділ фактичних перевірок |
| | Відділ перевірок фінансових операцій |
| | Відділ інформаційно-аналітичний, координації, звітності, аналізу та якості перевірок |
| | Кіцманський сектор перевірок платників |
| | Новоселицький сектор перевірок платників |
| 24-13-08 | Відділ запобігання фінансовим операціям, пов’язаним з легалізацією доходів, одержаних злочинним шляхом |
| 24-13-09 | Управління контролю за підакцизними товарами |
| | Відділ контролю за виробництвом та обігом спирту, спиртовмісної продукції, алкогольних напоїв, тютюнових виробів, рідин, що використовуються в електронних сигаретах, пального та контролю за обігом марки акцизного податку |
| | Відділ ліцензування торгівлі підакцизними товарами та зберігання пального |
| | Відділ адміністрування акцизного податку |
| | Відділ обслуговування акцизних складів та податкових постів |
| 24-13-10 | Управління фінансового забезпечення та бухгалтерського обліку |
| | Відділ бухгалтерського обліку, звітності та бюджетування |
| | Відділ оплати праці та обліку єдиного внеску |
| 24-13-11 | Відділ персоналу |
| 24-13-12 | Управління податкових сервісів |
| | Відділ обліку платників, об’єктів оподаткування, ведення реєстрів, податкових сервісів, реєстрації за окремими видами податків, ведення Державного реєстру фізичних осіб – платників податків, організації роботи ЦОП та надання адміністративних послуг, розгляду звернень державних органів |
| | Територіальний відділ податкових сервісів |
| 24-13-13 | Управління по роботі з податковим боргом |
| | Сектор моніторингу та інформаційно-аналітичного забезпечення |
| | Відділ супроводження судових спорів щодо банкрутства та стягнення заборгованості |
| | Відділ організації стягнення боргу та роботи з безхазяйним майном |
| | Відділ погашення боргу з фізичних осіб та заборгованості з ЄСВ |
| | Вижницький сектор по роботі з податковим боргом |
| | Кельменецький відділ по роботі з податковим боргом |
| | Кіцманський відділ по роботі з податковим боргом |
| | Новоселицький сектор по роботі з податковим боргом |
| 24-13-15 | Сектор охорони державної таємниці, технічного та криптографічного захисту інформації |
| 24-13-17 | Відділ інфраструктури та господарського забезпечення |
| 24-13-18 | Відділ з питань виявлення та опрацювання податкових ризиків |
| 24-13-19 | Управління економічного аналізу |
| | Відділ організації та моніторингу виконання показників доходів |
| | Відділ обліку платежів та зведеної звітності |
| | Відділ контролю обліково-звітних показників |
| 24-13-20 | Управління інформаційних технологій |
| | Відділ супроводження інформаційних систем, адміністрування баз даних |
| | Відділ технічної підтримки, електронного документообігу, адміністраторів безпеки та адміністрування служби каталогів |
| 24-13-22 | Сектор реєстрації користувачів |
| 24-13-23 | Сектор трансфертного ціноутворення |
| 24-13-24 | Управління оподаткування фізичних осіб |
| | Відділ адміністрування податків і зборів з фізичних осіб та єдиного внеску |
| | Сектор адміністрування податку на майно та місцевих зборів з фізичних осіб |
| | Сектор координації та інформаційно-аналітичного забезпечення |
| | Сектор розгляду звернень платників податків |
| | Відділ планових та позапланових перевірок оподаткування фізичних осіб |
| | Відділ перевірок податкових агентів |
| | Вижницький відділ податків і зборів з фізичних осіб та проведення камеральних перевірок |
| | Кельменецький відділ податків і зборів з фізичних осіб та проведення камеральних перевірок |
| | Кіцманський відділ податків і зборів з фізичних осіб та проведення камеральних перевірок |
| | Новоселицький відділ податків і зборів з фізичних осіб та проведення камеральних перевірок |
| | Чернівецький відділ податків і зборів з фізичних осіб та проведення камеральних перевірок |
| 24-13-30 | Сектор інформаційної взаємодії |
| 24-13-50 | Вижницька державна податкова інспекція |
| 24-13-51 | Дністровська державна податкова інспекція |
| | Відділ обліку платників, об'єктів оподаткування та ведення реєстрів |
| | Дністровський відділ обслуговування платників |
| 24-13-52 | Чернівецька державна податкова інспекція |
| | Відділ обліку платників, об'єктів оподаткування та ведення реєстрів |
| | Відділ надання адміністративних послуг, організації роботи та документообігу |
| | Глибоцький відділ обслуговування платників |
| | Кіцманський відділ обслуговування платників |